EVA results for 1juq:B

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....
seq	GSXAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTVLEACXKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTXALPEEAKIKDAYHXLKRQGIVQSDPPIPVDRTLI
dssp	-HHH-HHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---------E-------
apssp	----HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH-HH------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----------HHH-HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHH--HH-----------------	+1.2	+3.6	-0.14
jpred	---------HHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----------------	+6.0	+12.1	+0.02
phd	-------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EE------------	+16.6	+19.8	+0.17
phdpsi	----------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH----------------	+9.7	+11.7	+0.02
profsec	----------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------------	+11.2	+10.0	+0.13
psipred	----------HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH-----------------	+10.0	+8.5	+0.08
sspro2	---HH-----HHHHHHHH--HH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---E---------EE--	+6.7	+5.7	+0.01

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva