EVA results for 1jpl:B

DATE : 2002_02_27
TYPE : sec

Results

method	prediction	diff_Q3	diff_sov	diff_info
	....,....1....,....2....,....3....,....4....,....5....,....6....,....7....,....8....,....9....,....10...,....11...,....12...,....13...,....14...,....15...,....
seq	XGSXAEAEGESLESWLNKATNPSNRQEDWEYIIGFCDQINKELEGPQIAVRLLAHKIQSPQEWEALQALTVLEACXKNCGRRFHNEVGKFRFLNELIKVVSPKYLGDRVSEKVKTKVIELLYSWTXALPEEAKIKDAYHXLKRQGIVQSDPPIPVDRTL
dssp	--HHH-HHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH--HHHHHHHHHHH-----HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------
apssp	-----HHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHH-HH--HH--HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHH--HHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HH----------------	+1.2	+7.6	-0.17
jpred	-----------HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH----EEEEEE-HHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----------------	+7.3	+15.7	+0.06
phd	--------HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHH-HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHH---EE-----------	+17.8	+20.1	+0.2
phdpsi	----------HHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHH---------------	+9.7	+15.1	+0.02
profsec	-----------HHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------	+11.9	+13.1	+0.12
psipred	-----------HHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH----------------	+11.3	+12.6	+0.11
sspro2	----HH-----HHHHHHHH--HH-----HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHH-HHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHH---E------------	+9.2	+8.5	+0.04

Notations used

DATE : date when added [yyyy_mm_dd]
TYPE : prediction category
COMPND : from PDB:DSSP: compound
SOURCE : from PDB:DSSP: organism asf
AUTHOR : from PDB:DSSP: authors of PDB structure
method : name of prediction method
prediction: actual prediction
diff_Q3 : Q3(this protein) - Q3(average over all proteins)
with: three-state per-residue accuracy (percentage of correctly predicted residues)
diff_sov : Sov3(this protein) - Sov3(average over all proteins)
with: three-state per-segment accuracy (percentage of segment overlap)
diff_info : info(this protein) - info(average over all proteins)
with: info=(infoO + infoP)/2information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoO=information index accuracy (percentage of observed)
and with: infoP=information index accuracy (percentage of predicted)

Last update: Mar 13, 2002
Contact: rost@columbia.edu
WWW: http://cubic.bioc.columbia.edu/eva