DETECCIÓN Y MODELADO DE GENES.
Manuel J. Gómez,
Protein Design Group, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Cantoblanco
Ramón
Alonso-Allende, Protein Design Group, Centro Nacional de Biotecnología,
CSIC, Cantoblanco
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Introducción
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Definición
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Características de los genes Procariotas
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Características de los genes Eucariotas
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Diferentes estrategias en Procariotas y Eucariotas
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Información adicional
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Estrategia general y métodos de predicción
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Localización y enmascaramiento de secuencias repetidas
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Métodos de comparación (métodos Extrínsecos
o Comparative methods)
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Análisis de la secuencia de ADN a nivel de nucleótido
(Content-based methods)
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Análisis de señales o motivos (Signal-based methods)
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Busqueda en bases de datos de secuencias expresadas
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Información adicional
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Programas y bases de datos para identificar
y modelar genes
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Relación de programas y bases de datos
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Eficiencia de los programas
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Información adicional
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Procariotas 1: Streptomyces
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Procariotas 2: Bacillus
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Eucariotas 1: gen humano
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Eucariotas 2: gen de planta
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Eucariotas 3: secuencia humana de 100 Kb