El módulo de reconocimiento se estabiliza con dos iones metálicos tetrahédricamente coordinados por seis cisteínas. Dos de las cisteínas ligadas a ambos metales crean un "cluster" (racimo) binuclear. Las uniones azufre-zinc aportan la energía suficiente para la estabilización de la estructura de reconocimiento.
Iones Zinc,
Proteína Gal4,
Hebra 1 de ADN,
Hebra 2 de ADN.
+ 6 azufres
(radios van der Waals)
+ carbonos alfa de las cisteínas en representación de esferas.
(radios pequeños, 0.8 Angstroms).